21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  747    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  68.44 
 
 
376 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  56.59 
 
 
373 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  40.97 
 
 
370 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  33.99 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  30.52 
 
 
539 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  24.62 
 
 
1291 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  22.45 
 
 
1465 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.38 
 
 
1509 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  23.94 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24 
 
 
1488 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  23.74 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  22.13 
 
 
284 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  22.73 
 
 
298 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  22.22 
 
 
237 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  22.61 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  21.89 
 
 
594 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  23.74 
 
 
557 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  25.64 
 
 
284 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  24.87 
 
 
287 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  23.74 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>