15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1089    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  35.55 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  30.84 
 
 		 374 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  31.98 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  28.38 
 
 		 370 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.23 
 
 		 1509 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.23 
 
 		 1488 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1291 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  28.26 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.78 
 
 		 2144 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  25.64 
 
 		 557 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1465 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  22.92 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  27.56 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>