21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5166 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  61.52 
 
 		 376 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  57.03 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  43.3 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  43.06 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  35.55 
 
 		 539 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1465 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  27.05 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.05 
 
 		 1509 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.5 
 
 		 1488 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1291 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  23.28 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  25.81 
 
 		 594 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  23.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  22.59 
 
 		 557 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  25.37 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  28.14 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  28 
 
 		 229 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  22.11 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  24.76 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  21.1 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>