25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2528 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  597  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  29.18 
 
 
414 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  31.28 
 
 
594 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  30.93 
 
 
2144 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  32.12 
 
 
557 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  28.19 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.42 
 
 
1509 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  32.34 
 
 
1465 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  28.47 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  38.13 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  34.09 
 
 
1291 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  29.85 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.9 
 
 
1488 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  26.06 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  27.78 
 
 
412 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  31.82 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  27.36 
 
 
376 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  28.35 
 
 
466 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  23.3 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  25.37 
 
 
373 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  24.76 
 
 
539 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  27.59 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.756618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>