30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1045 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  823    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  51.32 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  37.97 
 
 		 238 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1465 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  35.04 
 
 		 1509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  38.72 
 
 		 233 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  35.32 
 
 		 237 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  33.99 
 
 		 1488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  34.44 
 
 		 2144 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  33.83 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  32.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  29.31 
 
 		 284 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  33.52 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  26.29 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  39.82 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  24.09 
 
 		 594 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  26.1 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  27.96 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1939 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1091  hypothetical protein  35.65 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.54384e-60 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  22.51 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  26.28 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  27.56 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  24.24 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  20.19 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  27.56 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  29.03 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  23.33 
 
 		 597 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>