17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  756    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  40.97 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  37.77 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  41.49 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  36.98 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  25 
 
 		 539 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1465 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.5 
 
 		 1509 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1291 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25 
 
 		 1488 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  25.45 
 
 		 594 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  22.05 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  23.89 
 
 		 2144 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  22.49 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  23.66 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  24.18 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>