24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5659 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  83.19 
 
 		 238 aa  364  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  42.55 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1465 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  35.32 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  36.64 
 
 		 1509 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  35.74 
 
 		 366 aa  131  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  36.57 
 
 		 1488 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1291 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  33.47 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  33.85 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2144 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  24.53 
 
 		 594 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  32.94 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  30.05 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  30.88 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  31.4 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  31.48 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  29.85 
 
 		 557 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  27.35 
 
 		 466 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  22.22 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  20.4 
 
 		 376 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  22.33 
 
 		 373 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>