25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4223 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1465 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1291 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  37.85 
 
 		 1509 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  33.74 
 
 		 237 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  28.77 
 
 		 594 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  32.58 
 
 		 412 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  33.21 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  34.31 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  36.71 
 
 		 1488 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  31.67 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  27.99 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  41.67 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  32.71 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  32.63 
 
 		 2144 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  35.56 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  27.95 
 
 		 414 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  23.55 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  33.5 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  31.67 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  31.5 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  23.38 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  27.78 
 
 		 466 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  25.4 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  27.18 
 
 		 539 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>