207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4515 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  96.72 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  96.72 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  96.72 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  95.26 
 
 
274 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  88.69 
 
 
274 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  90.51 
 
 
274 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  90.51 
 
 
290 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  90.51 
 
 
290 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  90.51 
 
 
290 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  90.51 
 
 
290 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  89.78 
 
 
274 aa  480  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  89.42 
 
 
290 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  69.34 
 
 
274 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  69.34 
 
 
274 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  61.31 
 
 
274 aa  361  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  60.95 
 
 
274 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  61.31 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  60.51 
 
 
276 aa  341  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  62.35 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  61.96 
 
 
277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  61.18 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  62.35 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  60.78 
 
 
277 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  61.57 
 
 
277 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  61.57 
 
 
277 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  50.54 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  51.26 
 
 
286 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  44.71 
 
 
308 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  44.31 
 
 
306 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  39.49 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  36.86 
 
 
241 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  34.89 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  35.27 
 
 
241 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  36.82 
 
 
241 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  36.82 
 
 
241 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  36.82 
 
 
241 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  34.89 
 
 
241 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  35.25 
 
 
241 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  32.58 
 
 
241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  34.25 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  33.86 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  34.05 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  32.74 
 
 
243 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  33.98 
 
 
243 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  32.74 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  32.74 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  32.44 
 
 
243 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  32.06 
 
 
243 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  32.06 
 
 
243 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  32.44 
 
 
243 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 
243 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  30.53 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  30.38 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  30.38 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  30.27 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  30.38 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  30.27 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  31.25 
 
 
504 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  31.6 
 
 
464 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  31.6 
 
 
464 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  31.6 
 
 
464 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  31.25 
 
 
463 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  30.18 
 
 
246 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  29.84 
 
 
245 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  28.73 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.33 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  29.96 
 
 
248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  27.6 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  25.49 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.54 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  23.02 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  24.9 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  25.36 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  27.64 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  25.71 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  26.81 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  24.29 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  30.62 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  28.07 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  24.01 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  29.19 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  25.82 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.19 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  25.12 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  25.59 
 
 
204 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>