More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1108 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 262 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  93.13 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  92.75 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  90.46 
 
 		 262 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  90.46 
 
 		 262 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  89.31 
 
 		 262 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.19 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  77.57 
 
 		 263 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.81 
 
 		 263 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.81 
 
 		 263 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  79.84 
 
 		 258 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.05 
 
 		 263 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.43 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.05 
 
 		 263 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.43 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  76.43 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  76.26 
 
 		 258 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  71.37 
 
 		 257 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.4 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.4 
 
 		 263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  65.23 
 
 		 257 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  66.12 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 		 263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  68.62 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  67.48 
 
 		 263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  62.45 
 
 		 262 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  63.64 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  65.69 
 
 		 263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  64.85 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  56.7 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  57.03 
 
 		 258 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.06 
 
 		 256 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.26 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  58.26 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  56.05 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  56.45 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  56.68 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  61.68 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  55.47 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.22 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  54 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  57.92 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  55.88 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  49.6 
 
 		 263 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.11 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.86 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.6 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.4 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.4 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.94 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.77 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  38 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.15 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.3 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.14 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  35.93 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.5 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  35.93 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.2 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  32.57 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.98 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 		 315 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  38.82 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.51 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.01 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  29.62 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.28 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 		 331 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  29 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  33 
 
 		 344 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  33 
 
 		 331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.51 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  26.79 
 
 		 319 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.62 
 
 		 331 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.05 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.02 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.02 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.02 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.13 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.54 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.09 
 
 		 501 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.14 
 
 		 495 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 		 374 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.21 
 
 		 334 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.63 
 
 		 334 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.63 
 
 		 334 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>