More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0457 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.65 
 
 
595 aa  813  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  86.71 
 
 
614 aa  1067  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  56.48 
 
 
582 aa  651  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  56.54 
 
 
578 aa  661  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  55.3 
 
 
581 aa  644  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  69.07 
 
 
600 aa  813  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  96.1 
 
 
615 aa  1219  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  81.83 
 
 
624 aa  1045  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  68.88 
 
 
605 aa  800  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  95.77 
 
 
615 aa  1214  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  95.77 
 
 
615 aa  1214  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
615 aa  1254  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  95.77 
 
 
616 aa  1195  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  97.07 
 
 
615 aa  1227  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  82.13 
 
 
621 aa  1048  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  86.22 
 
 
614 aa  1062  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  98.37 
 
 
615 aa  1240  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  56.72 
 
 
577 aa  657  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  81.96 
 
 
621 aa  1051  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.48 
 
 
595 aa  813  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  54.86 
 
 
580 aa  641  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.45 
 
 
590 aa  636  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.35 
 
 
582 aa  660  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  56.13 
 
 
590 aa  657  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  86.39 
 
 
614 aa  1065  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  67.83 
 
 
595 aa  820  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  54.78 
 
 
582 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  55.57 
 
 
580 aa  628  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  54.04 
 
 
614 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  53.73 
 
 
582 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.73 
 
 
582 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  53.77 
 
 
607 aa  618  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.79 
 
 
588 aa  614  1e-174  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  50.26 
 
 
618 aa  585  1e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  51.47 
 
 
630 aa  577  1e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  50.25 
 
 
594 aa  578  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  50.25 
 
 
594 aa  577  1e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 
632 aa  576  1e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 
632 aa  576  1e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  50.08 
 
 
594 aa  576  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 
632 aa  576  1e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  49.92 
 
 
594 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  49.92 
 
 
594 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  49.92 
 
 
594 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  50.43 
 
 
596 aa  572  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  49.92 
 
 
594 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  50.8 
 
 
631 aa  573  1e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  50.95 
 
 
630 aa  573  1e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  50.98 
 
 
578 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  48.78 
 
 
583 aa  549  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
577 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  48.48 
 
 
577 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  49.74 
 
 
587 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  43.62 
 
 
577 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.87 
 
 
570 aa  452  1e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.29 
 
 
575 aa  446  1e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.73 
 
 
581 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.91 
 
 
570 aa  439  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41.39 
 
 
587 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.28115e-11 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  43.13 
 
 
570 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  43.27 
 
 
552 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
548 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
571 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  44.01 
 
 
570 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  44.01 
 
 
570 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  44.19 
 
 
615 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  44.01 
 
 
570 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  44.19 
 
 
570 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  43.83 
 
 
570 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  42.64 
 
 
568 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  40.86 
 
 
580 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  38.93 
 
 
577 aa  425  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.55 
 
 
553 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.36 
 
 
553 aa  418  1e-115  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.7 
 
 
614 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  41.61 
 
 
578 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
575 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.49 
 
 
588 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  41.49 
 
 
588 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  41.49 
 
 
588 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.49 
 
 
588 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90417e-08 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  40.62 
 
 
586 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  41.49 
 
 
588 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  41.13 
 
 
565 aa  407  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  40.77 
 
 
579 aa  408  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  41.32 
 
 
565 aa  408  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  41.04 
 
 
588 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  40.14 
 
 
579 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>