More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4828 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  60.64 
 
 		 376 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  54.26 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  57.45 
 
 		 376 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  54.96 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  52.55 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  45.18 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  42.86 
 
 		 373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  44.57 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  42.55 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  38.93 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  39.26 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  41.74 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  38.67 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  39.01 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  36.49 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  35.58 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  34.97 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  31.43 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  31.43 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  33.52 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  33.33 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.92 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.56 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.6 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.46 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  47.79 
 
 		 123 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.52 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.62 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.62 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.33 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.98 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.83 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.85 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.37 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.57 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  25.85 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  28.07 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.67 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.56 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  26.36 
 
 		 374 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  26.36 
 
 		 374 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  34.24 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  31.52 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  31.94 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.6 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.69 
 
 		 408 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.17 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.89 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.8 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  28.97 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  34.4 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.54 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.23 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.65 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  32.64 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  34.55 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.71 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.78 
 
 		 397 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 		 446 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  31.31 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.94 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.42 
 
 		 368 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.17 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25.48 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  29.44 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00530  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.192511  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.17 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  30.31 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.75 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  25.69 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  25.41 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  25.48 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  25.48 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>