77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1386 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  82.85 
 
 		 274 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  82.85 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  83.94 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  83.94 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  83.21 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  83.21 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  83.21 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  52.03 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  46.08 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  49.65 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  48.21 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.56 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  44.93 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  47.01 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  45.93 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  46.67 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  46.01 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  38.64 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  33.96 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  37.13 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  35.41 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  36.13 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  41.73 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  40.45 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  34.69 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  36.13 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  32.98 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  35.36 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.98 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  50.4 
 
 		 126 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.95 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  34.24 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  38.02 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  32.82 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  35.02 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  33.21 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  31.45 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  33.21 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  34.12 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  31.05 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  36.18 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.47 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  30.91 
 
 		 286 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  36.47 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  30.31 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  33.21 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  38.58 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  37.8 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  37.8 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  31.62 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.91 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  27.54 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  28.78 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  33.18 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  32.72 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.65 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  32.26 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  24.11 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  30.28 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  31.8 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  29.82 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  29.82 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  25.64 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  30.14 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  31.31 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  29.68 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  29.41 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  31.66 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  48.44 
 
 		 307 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>