More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0899 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  100 
 
 
365 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  78.93 
 
 
394 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  78.68 
 
 
394 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  78.93 
 
 
394 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  77.23 
 
 
404 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  77.23 
 
 
404 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  77.23 
 
 
404 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  77.23 
 
 
404 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  60.71 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  60.77 
 
 
327 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  46.29 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  46.29 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  45.59 
 
 
321 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  45.98 
 
 
335 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  47.34 
 
 
305 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  46.67 
 
 
320 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  43.84 
 
 
327 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  44.81 
 
 
315 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  43.55 
 
 
327 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  46.33 
 
 
330 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  39.64 
 
 
335 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  40 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  36.31 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.82 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  38.1 
 
 
350 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  34.87 
 
 
355 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  36.92 
 
 
338 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  34.68 
 
 
370 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  34.69 
 
 
338 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.14 
 
 
367 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  36.12 
 
 
349 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  39.29 
 
 
345 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  33.03 
 
 
337 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  34.77 
 
 
332 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  37.97 
 
 
340 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.04 
 
 
343 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
374 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  32.94 
 
 
374 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
347 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  35.47 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  32.94 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.53 
 
 
341 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  32.74 
 
 
344 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  37.95 
 
 
331 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  37.43 
 
 
338 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  38.04 
 
 
362 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.14 
 
 
347 aa  176  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.75 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.69 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  31.87 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  35.47 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.91 
 
 
348 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
341 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.76 
 
 
348 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  32.08 
 
 
345 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 
343 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.13 
 
 
350 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.79 
 
 
353 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  33.81 
 
 
341 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.16 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.59 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  31.16 
 
 
351 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  31.16 
 
 
351 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.16 
 
 
351 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  31.16 
 
 
351 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  35.35 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.59 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.16 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.16 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.66 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.16 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.82 
 
 
331 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.01 
 
 
349 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.3 
 
 
350 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  33.82 
 
 
345 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.3 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.01 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  35.86 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  34.44 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.86 
 
 
351 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  34.21 
 
 
326 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.41 
 
 
351 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.3 
 
 
343 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.82 
 
 
361 aa  156  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  30 
 
 
349 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  34.31 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  33.92 
 
 
800 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  32 
 
 
338 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  32 
 
 
332 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  32 
 
 
332 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  36.88 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  27.33 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  30.95 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.569601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>