More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3231 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  93.68 
 
 
192 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  93.68 
 
 
192 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  87.37 
 
 
192 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  88.42 
 
 
191 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  87.37 
 
 
193 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  85.79 
 
 
222 aa  322  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  85.26 
 
 
191 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  71.43 
 
 
193 aa  270  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  66.49 
 
 
194 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  65.43 
 
 
196 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  65.43 
 
 
196 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  65.43 
 
 
196 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  65.08 
 
 
197 aa  255  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  65.08 
 
 
197 aa  255  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  65.26 
 
 
198 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  65.08 
 
 
197 aa  253  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  58.51 
 
 
196 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  58.51 
 
 
196 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  58.51 
 
 
196 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  58.51 
 
 
196 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  57.98 
 
 
196 aa  235  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  57.98 
 
 
196 aa  234  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.98 
 
 
196 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  57.98 
 
 
196 aa  234  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.98 
 
 
196 aa  234  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  49.74 
 
 
192 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  49.73 
 
 
217 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  51.11 
 
 
185 aa  174  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  47.22 
 
 
212 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  50.66 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  43.32 
 
 
202 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  46.71 
 
 
190 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  39.78 
 
 
318 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  42.86 
 
 
189 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.25 
 
 
186 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.23 
 
 
188 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.23 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  40.43 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.89 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.83 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  38.62 
 
 
231 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.34 
 
 
186 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.81 
 
 
184 aa  110  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.36 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.76 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
181 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.26 
 
 
184 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.92 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.91 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.02 
 
 
197 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.47 
 
 
219 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.7 
 
 
235 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  38.17 
 
 
187 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
189 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.76 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  39.13 
 
 
188 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 
201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 
201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
196 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 
205 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 
205 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.43 
 
 
192 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.32 
 
 
176 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
199 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 
186 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.81 
 
 
193 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
199 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
199 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.58 
 
 
204 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.34 
 
 
186 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.58 
 
 
204 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.78 
 
 
198 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.38 
 
 
210 aa  104  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  36.81 
 
 
206 aa  104  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
199 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  37.63 
 
 
183 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 
215 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.8 
 
 
186 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.8 
 
 
186 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  38.8 
 
 
186 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
188 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 
194 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.76 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 
184 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
186 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>