More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0389 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 		 238 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  51.07 
 
 		 236 aa  224  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 243 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  34.64 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  34.64 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.08 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 248 aa  98.2  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.52 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  32.32 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  28.77 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 262 aa  91.7  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  33.71 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 266 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.09 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>