108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0074 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  99.35 
 
 		 155 aa  300  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  84.21 
 
 		 153 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  50.99 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  47.33 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  46.67 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  50.67 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  44.14 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  42.75 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  45.83 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  44.67 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  42.38 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  44.08 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  45.89 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  48.98 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  40.67 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  39.07 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  36.49 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  41.43 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  43.57 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  42.06 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  39.44 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  42.06 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  36.3 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  38.03 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  36.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  34.29 
 
 		 147 aa  84  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  34.11 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  35 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  35.25 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  34.09 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  34.09 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  33.33 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  32.56 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  32.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  32.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  32.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  32.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  34.69 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  34.9 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  32.43 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  29.94 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  24.66 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  24.31 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  36.17 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  25.49 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  24.46 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  33.77 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  22.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.14 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  23.08 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  29.45 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  29.45 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  29.45 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  25.35 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  33.78 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.55 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.43 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  29.37 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  28 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  26.39 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2810  hypothetical protein  45.71 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547637  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  23.74 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  25.64 
 
 		 496 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  29.05 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  23.29 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  27.48 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>