46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2452 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  90.91 
 
 
165 aa  299  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  60.51 
 
 
157 aa  204  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  41.94 
 
 
154 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  38.16 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  40.82 
 
 
147 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  37.66 
 
 
150 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  32.24 
 
 
151 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  35.77 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  34.93 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  43.24 
 
 
148 aa  84  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  34.72 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  32.88 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  33.77 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  31.87 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  33.55 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.28 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  32.48 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  32.48 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  24.49 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  29.49 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.13 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.93 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  28.45 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  27.66 
 
 
154 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  27.89 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  25.52 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.33 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  32.65 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  24.67 
 
 
151 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  26.32 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  24.09 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>