More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4973 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  98.97 
 
 
290 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  95.17 
 
 
290 aa  577  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  95.17 
 
 
290 aa  577  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  94.14 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  94.14 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  92.76 
 
 
290 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  93.1 
 
 
290 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  93.45 
 
 
290 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  89.66 
 
 
290 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  67.59 
 
 
292 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  52.25 
 
 
291 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  51.9 
 
 
291 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  51.38 
 
 
280 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 
286 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  39.79 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
300 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 
287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  46.1 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  44.44 
 
 
281 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 
284 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.34 
 
 
281 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 
287 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  38.7 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  34.97 
 
 
288 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 
292 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
281 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 
313 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  36.77 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 
285 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 
290 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 
315 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  40.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 
281 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 
300 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  44.22 
 
 
200 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
300 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
300 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
300 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
300 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 
300 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
300 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  54.62 
 
 
265 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
300 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 
279 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 
279 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 
313 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  28.72 
 
 
279 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  24.33 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 
281 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 
277 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
298 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
293 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  33.95 
 
 
160 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 
291 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.58 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 
452 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  26.18 
 
 
306 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
140 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  22.92 
 
 
297 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  22.92 
 
 
297 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 
129 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 
271 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  23.15 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  24.31 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  31.21 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  31.21 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  31.21 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  31.21 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  23.03 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  23.89 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  22.97 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>