More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0070 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.01317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.37683e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  7.9318e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  5.44172e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.19651e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  99.34 
 
 
161 aa  298  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.57952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  99.34 
 
 
161 aa  298  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.41067e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  98.03 
 
 
161 aa  294  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.17621e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  90.73 
 
 
152 aa  261  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.48596e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  67.55 
 
 
132 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.38948e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  64.24 
 
 
132 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  55.35 
 
 
133 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.00816e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  55.35 
 
 
133 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  4.17558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  56.6 
 
 
133 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  52.53 
 
 
130 aa  146  1e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.04617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.25 
 
 
126 aa  139  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  51.7 
 
 
134 aa  138  4e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  49.69 
 
 
128 aa  138  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.17569e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  47.17 
 
 
140 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.44376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  49.03 
 
 
124 aa  133  1e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  44.65 
 
 
144 aa  129  2e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.20475e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.2 
 
 
164 aa  128  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  42.5 
 
 
140 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.83919e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  44.59 
 
 
134 aa  116  1e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.79369e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  44.59 
 
 
134 aa  116  1e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  9.39181e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  45.1 
 
 
152 aa  112  2e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  43.42 
 
 
120 aa  109  1e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.31287e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  40.51 
 
 
120 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.91466e-13  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  46.54 
 
 
134 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.84856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  39.06 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.85 
 
 
705 aa  83.2  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  53.95 
 
 
133 aa  82  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  45.45 
 
 
129 aa  81.3  6e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  47.73 
 
 
125 aa  80.5  8e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.5  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.5  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  53.95 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  49.37 
 
 
121 aa  79.3  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  34.64 
 
 
140 aa  78.2  4e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.52887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.73 
 
 
706 aa  78.2  5e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  50.63 
 
 
734 aa  77.8  6e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
734 aa  77.8  6e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.28 
 
 
705 aa  77.8  6e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  53.52 
 
 
376 aa  77.8  6e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  46.43 
 
 
124 aa  77.8  6e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.52 
 
 
772 aa  77.8  6e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  50 
 
 
686 aa  77.4  7e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  50.63 
 
 
711 aa  77.4  8e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.73 
 
 
706 aa  77  9e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.63 
 
 
711 aa  77  9e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.37 
 
 
706 aa  77  1e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 
698 aa  76.3  2e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.57 
 
 
700 aa  76.3  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.90055e-06  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.74 
 
 
733 aa  76.3  2e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.52 
 
 
123 aa  75.9  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  1.94904e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.37 
 
 
711 aa  76.3  2e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.35 
 
 
722 aa  75.9  2e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 
698 aa  75.5  3e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0673762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3275  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.37 
 
 
700 aa  74.3  6e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.61182e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3412  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.37 
 
 
700 aa  74.3  6e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.44924e-06  hitchhiker  0.000972679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.56 
 
 
722 aa  73.9  7e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  48.24 
 
 
399 aa  74.3  7e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.36762e-12  decreased coverage  3.02812e-15 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.37 
 
 
703 aa  74.3  7e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.96899e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  7e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.74082e-05  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1133  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  8e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.84141e-07  unclonable  1.21656e-11 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0861  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.86 
 
 
720 aa  73.9  8e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2829  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  8e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.62505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  73.9  8e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  8e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.90234e-06  hitchhiker  6.30128e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1019  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 
701 aa  73.9  8e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.61081e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  73.9  8e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  8e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
699 aa  73.9  8e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.2543e-06  hitchhiker  5.83672e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  73.9  8e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
702 aa  73.9  9e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.88 
 
 
713 aa  73.6  1e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.61 
 
 
124 aa  72.4  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  8.79414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  51.43 
 
 
720 aa  73.2  2e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01817  Polynucleotide phosphorylase  44.58 
 
 
353 aa  72.8  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00061601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0729  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  49.33 
 
 
695 aa  72.8  2e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>