119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7062 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
377 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  50.4 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  40.48 
 
 
376 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.43 
 
 
375 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  40.48 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  40.32 
 
 
410 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  38.2 
 
 
402 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
407 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 
392 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  33.66 
 
 
415 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
414 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
406 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  28.65 
 
 
374 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  30.38 
 
 
384 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  29.46 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  29.64 
 
 
385 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  28.35 
 
 
383 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  28.35 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  30.15 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  31.2 
 
 
388 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  27.46 
 
 
392 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  28.08 
 
 
385 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  29.79 
 
 
390 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  28.88 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  29.41 
 
 
390 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  29.14 
 
 
390 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  29.69 
 
 
388 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.98 
 
 
366 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
379 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  27.42 
 
 
388 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  27.11 
 
 
397 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  28.38 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  27.81 
 
 
391 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  27.81 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  26.44 
 
 
392 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 
378 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  27.42 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  26.49 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  25.39 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  25.06 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  26.79 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.46 
 
 
378 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
378 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  25.89 
 
 
392 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
378 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
378 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  26.25 
 
 
380 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  25.96 
 
 
378 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
386 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
380 aa  106  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  24.59 
 
 
378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  24.01 
 
 
384 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 
381 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  26.81 
 
 
398 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  23.95 
 
 
393 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.07 
 
 
378 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  27.39 
 
 
378 aa  99.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  23.75 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  25.59 
 
 
389 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  25.39 
 
 
389 aa  96.7  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25.32 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  26.48 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  26.84 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  27.01 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  24.35 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  26.6 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  26.6 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  26.6 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  28.54 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  27.74 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  26.37 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.19 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  28.29 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  25.92 
 
 
401 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  22.8 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  24.73 
 
 
401 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  25.12 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  26.27 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.49 
 
 
349 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.78 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  27.85 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  22.39 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.99 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>