More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6710 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  100 
 
 
507 aa  1004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 
517 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.97 
 
 
517 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 
517 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.82 
 
 
517 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  62.3 
 
 
517 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  62.3 
 
 
517 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  62.3 
 
 
517 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  62.3 
 
 
517 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  62.06 
 
 
517 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  62.06 
 
 
517 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 
517 aa  605  1e-172  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  61.95 
 
 
519 aa  605  1e-172  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  66.06 
 
 
496 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  60.28 
 
 
518 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
510 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  56.06 
 
 
506 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  55.53 
 
 
506 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.82 
 
 
507 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  55.86 
 
 
507 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  55.82 
 
 
507 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  56.2 
 
 
506 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  53.85 
 
 
517 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  46.14 
 
 
502 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
501 aa  439  1e-122  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.34 
 
 
501 aa  441  1e-122  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.8 
 
 
497 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.89 
 
 
501 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.61 
 
 
495 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  46.92 
 
 
501 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  48.39 
 
 
499 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  47.73 
 
 
509 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  46.25 
 
 
505 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
506 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.88 
 
 
492 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.75 
 
 
501 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  9.93507e-07 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  45.36 
 
 
507 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  46.34 
 
 
501 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.19 
 
 
500 aa  416  1e-115  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.8 
 
 
495 aa  416  1e-115  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  48.4 
 
 
519 aa  417  1e-115  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.51 
 
 
496 aa  415  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  43.78 
 
 
503 aa  418  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
507 aa  416  1e-115  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  44.15 
 
 
503 aa  417  1e-115  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 
492 aa  416  1e-115  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 
504 aa  416  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.85 
 
 
501 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
521 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.82 
 
 
501 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  46.08 
 
 
500 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  45.13 
 
 
504 aa  415  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.47 
 
 
501 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  44.38 
 
 
507 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.6 
 
 
494 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
517 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  44.73 
 
 
512 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
504 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.85 
 
 
501 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  43.17 
 
 
501 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.83 
 
 
509 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
511 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
516 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.63 
 
 
520 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.45 
 
 
501 aa  412  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.14 
 
 
499 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  43.66 
 
 
499 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.14 
 
 
499 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.11 
 
 
504 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.29 
 
 
501 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.29 
 
 
501 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
506 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.27 
 
 
501 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.29 
 
 
495 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.4 
 
 
497 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
516 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.41 
 
 
513 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
507 aa  408  1e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 
500 aa  406  1e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
501 aa  407  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 
523 aa  406  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.94 
 
 
496 aa  408  1e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.97744e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
523 aa  408  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.21 
 
 
512 aa  406  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 
523 aa  406  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  45.13 
 
 
505 aa  407  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
516 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.73 
 
 
495 aa  407  1e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
507 aa  408  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
516 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  408  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.34 
 
 
515 aa  407  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  45.31 
 
 
501 aa  407  1e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
501 aa  407  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  44.73 
 
 
508 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>