37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5554 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  61.47 
 
 		 2025 aa  2330    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  64.24 
 
 		 1799 aa  2273    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  62.89 
 
 		 1981 aa  2347    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  55.88 
 
 		 1993 aa  1617    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  59.07 
 
 		 2115 aa  1436    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  68.43 
 
 		 1850 aa  2467    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  100 
 
 		 1874 aa  3705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1411 aa  324  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  29.48 
 
 		 2327 aa  291  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  31.95 
 
 		 2797 aa  283  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  32.48 
 
 		 2797 aa  283  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  31.25 
 
 		 2665 aa  258  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  27.92 
 
 		 2487 aa  253  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  32.96 
 
 		 2955 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1582 aa  244  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1557 aa  243  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1652 aa  234  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  28.83 
 
 		 2016 aa  232  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  36.12 
 
 		 3296 aa  226  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 		 2052 aa  220  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1587 aa  213  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  27.69 
 
 		 2335 aa  209  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  26.4 
 
 		 2331 aa  208  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  25.85 
 
 		 2252 aa  197  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1543 aa  141  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  35.59 
 
 		 764 aa  111  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1099 aa  59.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  18.57 
 
 		 7659 aa  58.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 691 aa  55.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  22.65 
 
 		 708 aa  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  32.11 
 
 		 810 aa  51.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  28.18 
 
 		 787 aa  50.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  23.74 
 
 		 185 aa  50.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  30.28 
 
 		 864 aa  48.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  29.97 
 
 		 1584 aa  47  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1450 aa  47  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  27.78 
 
 		 179 aa  47  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>