29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1240 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0885  hypothetical protein  70.27 
 
 		 141 aa  218  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  63.44 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1814  hypothetical protein  50.87 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0131  hypothetical protein  58.6 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1836  hypothetical protein  58.38 
 
 		 134 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1547  hypothetical protein  52.97 
 
 		 130 aa  161  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0287  hypothetical protein  52.69 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  33.71 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  39.1 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  27.45 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1850 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1874 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  22.12 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  30 
 
 		 2487 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G34  BdrW  26.85 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  30.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  21.51 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  29.73 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  23.03 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  25.17 
 
 		 2025 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  24.26 
 
 		 2115 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  27.89 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1799 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1215  hypothetical protein  26.39 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  31.63 
 
 		 1153 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  30.59 
 
 		 334 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92737  predicted protein  33.33 
 
 		 954 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0213576  normal  0.529709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1993 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>