12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1215 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1215  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  22.22 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  21.51 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  33.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  36.21 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  26.39 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3447  hypothetical protein  35.59 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0287  hypothetical protein  34 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1836  hypothetical protein  28.85 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2667  hypothetical protein  26.92 
 
 		 333 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  33.9 
 
 		 113 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>