More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0338 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
260 aa  539  1e-152  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.34 
 
 
261 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  78.99 
 
 
259 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  77.56 
 
 
259 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  77.73 
 
 
259 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  74.71 
 
 
259 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.23 
 
 
259 aa  319  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  58.58 
 
 
262 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  55.95 
 
 
258 aa  302  4e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.69 
 
 
258 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  53.75 
 
 
257 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  57.42 
 
 
257 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  58.92 
 
 
241 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.82 
 
 
263 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  53.64 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  53.06 
 
 
263 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.88 
 
 
263 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.88 
 
 
263 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  53.54 
 
 
258 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.49 
 
 
263 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.49 
 
 
263 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  54.15 
 
 
263 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.49 
 
 
263 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.49 
 
 
263 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.1 
 
 
263 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.47 
 
 
263 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.47 
 
 
263 aa  284  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  54 
 
 
262 aa  282  4e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.62 
 
 
256 aa  282  5e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  53.6 
 
 
262 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.8 
 
 
262 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  54.15 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  55.69 
 
 
263 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.8 
 
 
262 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.8 
 
 
262 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  52.8 
 
 
262 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  53.7 
 
 
263 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.92 
 
 
262 aa  272  4e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  51.43 
 
 
255 aa  272  4e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  54.27 
 
 
249 aa  271  5e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  53.88 
 
 
249 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  51.68 
 
 
255 aa  266  3e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  56.22 
 
 
263 aa  265  6e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  55.79 
 
 
263 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.56 
 
 
215 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  54.38 
 
 
255 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  48.84 
 
 
263 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  54.38 
 
 
255 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  56.71 
 
 
241 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.37 
 
 
239 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  40.32 
 
 
258 aa  178  6e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.08 
 
 
262 aa  173  2e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.08 
 
 
262 aa  173  2e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  37.55 
 
 
258 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.79 
 
 
234 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  37.35 
 
 
256 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
262 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.37 
 
 
251 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.28 
 
 
256 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
256 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.25 
 
 
240 aa  147  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
315 aa  146  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.21 
 
 
234 aa  145  4e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.19 
 
 
259 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.34 
 
 
234 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
315 aa  145  7e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 
247 aa  145  8e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.21 
 
 
234 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 
247 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.01 
 
 
249 aa  140  2e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  35.19 
 
 
247 aa  138  8e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.29 
 
 
319 aa  131  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.27 
 
 
233 aa  128  7e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
234 aa  121  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  41.04 
 
 
318 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.95 
 
 
495 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.18 
 
 
253 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.86 
 
 
501 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 
374 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.46 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.03 
 
 
237 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.19 
 
 
229 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  3.87868e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 
331 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
228 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.91 
 
 
331 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  28.63 
 
 
227 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.54 
 
 
517 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.45 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.09 
 
 
331 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.58 
 
 
332 aa  85.9  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.12 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.11 
 
 
332 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.13 
 
 
331 aa  84.7  1e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.12 
 
 
331 aa  84.7  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  3.62399e-08 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.12 
 
 
336 aa  85.1  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 
198 aa  84  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.75 
 
 
331 aa  84  2e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.21 
 
 
334 aa  84.3  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.75 
 
 
331 aa  84  2e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.75 
 
 
331 aa  84  2e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>