More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7347 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  100 
 
 
320 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.64 
 
 
318 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.66 
 
 
318 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.45 
 
 
309 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.8 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  54.21 
 
 
275 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.14 
 
 
297 aa  278  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
316 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
308 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
296 aa  235  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
299 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
317 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
316 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
316 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  42.61 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
306 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
292 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.78 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
299 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
309 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
300 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
306 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 
316 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
310 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
313 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
310 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
353 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
314 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
317 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
311 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  40.54 
 
 
321 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  41.58 
 
 
305 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
309 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
321 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
313 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
310 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
314 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
299 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
319 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  38.41 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
316 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  40.55 
 
 
294 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  40.98 
 
 
319 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.42 
 
 
314 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
293 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 
319 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.44 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.14 
 
 
294 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  34.93 
 
 
289 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
294 aa  195  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
308 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
318 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
292 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
291 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
315 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  34.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
290 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
325 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
293 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
321 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
288 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
314 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
312 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
291 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
340 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00310659  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  37.73 
 
 
321 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.45 
 
 
310 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
316 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  36.81 
 
 
306 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
308 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.25 
 
 
314 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
315 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
296 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  38.6 
 
 
322 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
352 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.963086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
300 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  40.36 
 
 
300 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
318 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
320 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
299 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
420 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
316 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
311 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
298 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
305 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  39.72 
 
 
311 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  38.23 
 
 
293 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
306 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>