225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5865 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  67.84 
 
 		 272 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  60.87 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  59.76 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  59.76 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  59.76 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  59.36 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  59.36 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  59.36 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  59.36 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  60.16 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  59.76 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  58.63 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  58.63 
 
 		 252 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  60.16 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  59.18 
 
 		 270 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  55.69 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  52.78 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  55.69 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  55.69 
 
 		 252 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  53.78 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  55.28 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  54.88 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  52.57 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  53.66 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.85 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  43.97 
 
 		 304 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  42.41 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  41.43 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  42.41 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  41.11 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  42.35 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  41.5 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  42.58 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  41.04 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  40.87 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.13 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  43.24 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.04 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  42.35 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  40.78 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  40.78 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  38.89 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  41.63 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  41.31 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  38.34 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  38.67 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  37.85 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  41.47 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.35 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  42.23 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.26 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.27 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  40.23 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  40.65 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  40.23 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  40.23 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00886  Lactam utilization protein lamB [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38096]  41.25 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  41.34 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.3 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.38 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  38.25 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  38.33 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  37.05 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  37.45 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  35.83 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  38.34 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  37.55 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  38.22 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  37.5 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  40.86 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  37.9 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>