225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2951 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  95.77 
 
 
260 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  91.92 
 
 
260 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  81.03 
 
 
266 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  81.42 
 
 
266 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  81.03 
 
 
266 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  81.03 
 
 
266 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  81.42 
 
 
266 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  81.42 
 
 
266 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  81.03 
 
 
266 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  73.2 
 
 
252 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  73.49 
 
 
252 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  71.37 
 
 
270 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  71.89 
 
 
277 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  66.27 
 
 
275 aa  353  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  66.67 
 
 
251 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  66.14 
 
 
252 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  65.74 
 
 
252 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  61.24 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  64.94 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  64.94 
 
 
252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  61.75 
 
 
264 aa  331  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  64.78 
 
 
272 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  64.8 
 
 
251 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  60.96 
 
 
259 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  60.16 
 
 
258 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 
257 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 
254 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 
256 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  41.11 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 
253 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 
254 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 
254 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
257 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.83 
 
 
255 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
274 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  43.42 
 
 
252 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  41.83 
 
 
255 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  38.71 
 
 
252 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.96 
 
 
255 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 
254 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.96 
 
 
255 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  38.89 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  39.83 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.55 
 
 
255 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  41.34 
 
 
251 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 
254 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.74 
 
 
255 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 
254 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 
254 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 
254 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  37.4 
 
 
250 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  35.18 
 
 
253 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  43.53 
 
 
258 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  39.59 
 
 
251 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.45 
 
 
253 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 
254 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
255 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  39.6 
 
 
255 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 
301 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  35.18 
 
 
253 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  35.18 
 
 
253 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  36.22 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  35.18 
 
 
253 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  38.37 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  34.78 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  38.37 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  39.52 
 
 
252 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 
250 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  39.77 
 
 
255 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  37.4 
 
 
254 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
258 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 
254 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  40.39 
 
 
250 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  43.35 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  34.39 
 
 
253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  41.48 
 
 
264 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  34.39 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  34.39 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  34.39 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 
273 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 
255 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
257 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  39.61 
 
 
261 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 
256 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  39.18 
 
 
254 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
255 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>