72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3251 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  72.19 
 
 		 367 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  71.63 
 
 		 367 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  71.35 
 
 		 367 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  64.17 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  61 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  55.03 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  55.77 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  55.77 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  55.21 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  55.49 
 
 		 366 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  56.46 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  55.49 
 
 		 366 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  54.37 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  54.65 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  54.75 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  54.65 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  54.65 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  54.24 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  56.08 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  53.08 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  53.37 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  52.15 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.33 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.27 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  52.42 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  51.84 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  45.98 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  45.98 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  44.5 
 
 		 376 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  43.84 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  42.29 
 
 		 385 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  39.11 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  38.61 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  38.06 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 392 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.46 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  30.58 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  30.42 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  29.62 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  28.8 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.62 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.67 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  24.44 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  24.43 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  24.43 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  24.71 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  24.71 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  24.71 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  24.71 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.46 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  24.43 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  26.45 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  22.46 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  25.81 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  28.22 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  23.16 
 
 		 454 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  21.53 
 
 		 934 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.47 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  27.61 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  25.23 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  24.18 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  21.01 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  26.99 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  25.84 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>