79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1192 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  100 
 
 		 445 aa  885    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  27.07 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  26.33 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  22.83 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  24.55 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  24.11 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  25.61 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  23.32 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  22.7 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  25.59 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  25.59 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  23.45 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  25.33 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  25.33 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  25.33 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  25.33 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  25.33 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  25.33 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  24.2 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  25.33 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  22.42 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  25 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  25.2 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  25.19 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  24.2 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  25 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  25 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  25 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  24.93 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  24.93 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  23.7 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  23.7 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  24.35 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  24.35 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  24.09 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  24.09 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  24.03 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  23.02 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  21.98 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.68 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.68 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 431 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  30.65 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  28.03 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  30.65 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>