145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0010 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  100 
 
 
381 aa  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  67.11 
 
 
372 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  66.05 
 
 
372 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  59.25 
 
 
372 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  51.1 
 
 
369 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  51.38 
 
 
362 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  52.49 
 
 
365 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  49.17 
 
 
368 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.6 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.14 
 
 
543 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  37.12 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  38.95 
 
 
542 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.17 
 
 
506 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  38.04 
 
 
396 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  40.72 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  39.18 
 
 
492 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  35.48 
 
 
475 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  36.59 
 
 
383 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  38.81 
 
 
398 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  36.76 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  36.78 
 
 
418 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  36.02 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  32.96 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  35.05 
 
 
405 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  35.46 
 
 
514 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.74 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  34.13 
 
 
404 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.94 
 
 
400 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.16 
 
 
404 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  35.67 
 
 
407 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  36.55 
 
 
416 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  32.97 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.04 
 
 
351 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  34.24 
 
 
354 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  35.9 
 
 
384 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  29.08 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  29.08 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  31.25 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  32.39 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  35.35 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  38.71 
 
 
440 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  31.51 
 
 
352 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  32.53 
 
 
405 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  33.42 
 
 
338 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  32.29 
 
 
418 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  38.44 
 
 
401 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  30.36 
 
 
375 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.33 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  33.96 
 
 
405 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  31.51 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  32.44 
 
 
402 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  32.44 
 
 
380 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  36.33 
 
 
412 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.77 
 
 
374 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  31.12 
 
 
410 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  30.87 
 
 
382 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  34.73 
 
 
386 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.15 
 
 
399 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  30.36 
 
 
376 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  32.36 
 
 
413 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  31.12 
 
 
374 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  32.05 
 
 
421 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  33.42 
 
 
435 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  32.61 
 
 
341 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  32.61 
 
 
341 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  31.48 
 
 
410 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  36.95 
 
 
407 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  31.87 
 
 
385 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  32.71 
 
 
433 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  32.15 
 
 
395 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  33.77 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  35.69 
 
 
381 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  31.88 
 
 
395 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  30.48 
 
 
410 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  30.32 
 
 
374 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  33.76 
 
 
402 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  32.35 
 
 
422 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  34.77 
 
 
395 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  33.44 
 
 
403 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  30.21 
 
 
410 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.21 
 
 
410 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  32.29 
 
 
386 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  30.32 
 
 
410 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  29.84 
 
 
380 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  36.59 
 
 
412 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  34.07 
 
 
416 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  32.27 
 
 
383 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  29.57 
 
 
384 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  29.95 
 
 
409 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  33.11 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  33.11 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  29.33 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  29.3 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  33.11 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
425 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
425 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
425 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
425 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
372 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  28.8 
 
 
382 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>