52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2657 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1098    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  36.8 
 
 
533 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  36.38 
 
 
533 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  31.55 
 
 
532 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  35.57 
 
 
535 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  35.33 
 
 
526 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  33.52 
 
 
517 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  34.23 
 
 
528 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  34.03 
 
 
528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  33.39 
 
 
546 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  33.52 
 
 
546 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  32.89 
 
 
546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  26.63 
 
 
543 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  29.64 
 
 
569 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.67 
 
 
557 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  30.91 
 
 
592 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  30.91 
 
 
592 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.27 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  27.7 
 
 
605 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  27.46 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.93 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
513 aa  67  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  27.33 
 
 
557 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  27.33 
 
 
557 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  28.99 
 
 
531 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.54 
 
 
529 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  30.54 
 
 
658 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  36.19 
 
 
563 aa  57.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  27.56 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  29.59 
 
 
516 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  29.59 
 
 
516 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  28.82 
 
 
638 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  28.99 
 
 
516 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  28.99 
 
 
516 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  27.27 
 
 
616 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  29.03 
 
 
564 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  26.7 
 
 
729 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  28.4 
 
 
516 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  29.31 
 
 
558 aa  51.2  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
618 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
543 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.52 
 
 
492 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  26.29 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  45.68 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.58 
 
 
507 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  28.89 
 
 
588 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  24.89 
 
 
607 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  24.05 
 
 
618 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  24.15 
 
 
726 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
560 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>