More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2266 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  100 
 
 
499 aa  1013    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
499 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  51.62 
 
 
508 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  50.3 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  50.41 
 
 
503 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  49.19 
 
 
512 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  49.4 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  53.67 
 
 
495 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  48.7 
 
 
509 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.97 
 
 
513 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.36 
 
 
513 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  47.7 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.39 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.39 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  48.37 
 
 
501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  46.45 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  50.51 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.48 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  50.31 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.19 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.76 
 
 
520 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  50.3 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.78 
 
 
516 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  48.1 
 
 
513 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  50.49 
 
 
505 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  47.49 
 
 
507 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.48 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.87 
 
 
512 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.79 
 
 
497 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.69 
 
 
517 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  45.55 
 
 
515 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.71 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  50.3 
 
 
498 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.15 
 
 
524 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 
527 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.08 
 
 
504 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.94 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.55 
 
 
524 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.75 
 
 
524 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.26 
 
 
513 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
504 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.94 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.03 
 
 
503 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.75 
 
 
516 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.75 
 
 
524 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  47.71 
 
 
501 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  48.06 
 
 
495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  46.51 
 
 
503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  45.55 
 
 
524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  48.57 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.51 
 
 
499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  46.54 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  45.55 
 
 
524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  46.48 
 
 
514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.21 
 
 
518 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  48.8 
 
 
500 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.23 
 
 
495 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
494 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.27 
 
 
514 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  48.07 
 
 
499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  49.6 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  48.07 
 
 
499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.58 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  48.49 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  46.14 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  45.92 
 
 
508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.09 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  44.65 
 
 
521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.25 
 
 
501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.03 
 
 
508 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.86 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  48.88 
 
 
500 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
523 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
497 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.55 
 
 
525 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  44.51 
 
 
508 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  46.36 
 
 
506 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  46.59 
 
 
518 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 
496 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 
525 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
518 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  45.03 
 
 
501 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
496 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.29 
 
 
492 aa  435  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  44.83 
 
 
501 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  45.88 
 
 
495 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  46.8 
 
 
509 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  44.11 
 
 
513 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.37 
 
 
504 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  47 
 
 
504 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.24 
 
 
501 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  46.8 
 
 
520 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
515 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  45.34 
 
 
500 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  44.83 
 
 
501 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  48.28 
 
 
494 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
500 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
494 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  43.63 
 
 
516 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>