252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0548 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  53.85 
 
 
1109 aa  967  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  50.39 
 
 
1045 aa  866  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  100 
 
 
1006 aa  1989  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  45.21 
 
 
994 aa  736  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  44.06 
 
 
971 aa  645  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.72 
 
 
1000 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  40.96 
 
 
1312 aa  577  1e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  34.13 
 
 
983 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  34.73 
 
 
1042 aa  353  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  36.16 
 
 
1099 aa  315  2e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.18 
 
 
1099 aa  308  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  38.17 
 
 
1116 aa  306  1e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  34.54 
 
 
1109 aa  297  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  35.52 
 
 
1115 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  2.04116e-09 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  31.48 
 
 
1406 aa  291  5e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
1474 aa  286  1e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  32.03 
 
 
1258 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  33 
 
 
1265 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 
1199 aa  265  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.64 
 
 
1649 aa  264  7e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
1659 aa  254  8e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  29.86 
 
 
1287 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  28.88 
 
 
1634 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.28 
 
 
1648 aa  245  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.11 
 
 
1312 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  30.47 
 
 
1298 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  30.08 
 
 
1298 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.16 
 
 
1648 aa  240  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  31.19 
 
 
1725 aa  240  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.16 
 
 
1648 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  30.25 
 
 
1298 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.44 
 
 
1399 aa  234  4e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.12 
 
 
1649 aa  234  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  29.79 
 
 
1298 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  28.56 
 
 
1300 aa  231  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.93 
 
 
1645 aa  230  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  30.06 
 
 
1639 aa  223  1e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.26 
 
 
1293 aa  222  2e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.68 
 
 
1638 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  30.36 
 
 
1705 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  1.60097e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  30.36 
 
 
1705 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.76 
 
 
1638 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  28.61 
 
 
1300 aa  218  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
1706 aa  213  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.63 
 
 
1705 aa  212  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  29.83 
 
 
1739 aa  207  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  29.46 
 
 
1638 aa  207  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.39 
 
 
1283 aa  207  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  29.81 
 
 
1683 aa  200  1e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  35.67 
 
 
962 aa  197  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  28.68 
 
 
1321 aa  186  2e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
1669 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 
1286 aa  183  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.6 
 
 
1292 aa  182  3e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.02 
 
 
728 aa  157  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.14 
 
 
1160 aa  152  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  28.04 
 
 
1406 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  28.04 
 
 
1407 aa  135  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  28.04 
 
 
1407 aa  135  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  27.75 
 
 
1407 aa  132  4e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.14 
 
 
917 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.7 
 
 
1035 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  25.24 
 
 
917 aa  122  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  28.57 
 
 
917 aa  122  4e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  28.57 
 
 
917 aa  121  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  29.1 
 
 
917 aa  121  8e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  28.27 
 
 
917 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  28.27 
 
 
917 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.08 
 
 
917 aa  117  7e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 
915 aa  117  8e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  27.88 
 
 
917 aa  117  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 
660 aa  116  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.81 
 
 
1618 aa  112  4e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.53 
 
 
1323 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 
891 aa  95.9  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.69 
 
 
1570 aa  92  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 
860 aa  89.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1060 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.63 
 
 
1776 aa  89  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.06 
 
 
1092 aa  83.6  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
1253 aa  79  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  25.13 
 
 
1809 aa  78.6  6e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  40.28 
 
 
1239 aa  77.8  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.42 
 
 
1078 aa  76.3  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  30.45 
 
 
1221 aa  75.5  4e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  29.4 
 
 
1215 aa  75.9  4e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.9 
 
 
883 aa  75.5  4e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  41.03 
 
 
1333 aa  75.1  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
860 aa  74.3  9e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  24.77 
 
 
1220 aa  73.9  1e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.58142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26 
 
 
1962 aa  73.6  2e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  43.4 
 
 
644 aa  71.6  7e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.24 
 
 
1405 aa  71.6  7e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.64 
 
 
1234 aa  70.1  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.95 
 
 
1212 aa  70.1  2e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  35.23 
 
 
1324 aa  68.2  7e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2279  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.6 
 
 
589 aa  67.8  9e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.17 
 
 
1191 aa  67.8  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25 
 
 
1570 aa  67  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  23.64 
 
 
1233 aa  67  2e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>