62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1581 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
378 aa  745    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 
392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 
396 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  27.07 
 
 
399 aa  116  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  25.43 
 
 
405 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  26.28 
 
 
332 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  25.77 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.48 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  23.64 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.85 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
394 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  23.88 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  29.49 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  28.12 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  26.63 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
414 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.23 
 
 
487 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  24.77 
 
 
403 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  24.79 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.85 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.85 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.11 
 
 
465 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
400 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  28.65 
 
 
432 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
472 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.81 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  26.63 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.89 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  22.62 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  21.72 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  22.11 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.39 
 
 
495 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  22.92 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  22.11 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  22.19 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.57 
 
 
465 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  25.62 
 
 
459 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  27.5 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.89 
 
 
522 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  25.48 
 
 
491 aa  43.5  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  25.91 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.37 
 
 
472 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.45 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 
425 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  27.88 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 
393 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
391 aa  42.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>