More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0225 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44.87 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  34.75 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  36.08 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  46.58 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  36.63 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  30.36 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  41.43 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  32.05 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  34.21 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.26 
 
 		 468 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  27.5 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  45.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  32.89 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.66 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  27.5 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  27.5 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 477 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>