More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4189 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  244  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  70.16 
 
 		 126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  74.19 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  66.94 
 
 		 125 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  68.55 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  71.77 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  70.97 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  67.48 
 
 		 123 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  70.16 
 
 		 123 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  42.11 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  30.7 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.97 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  42.86 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  27.12 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 498 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  28.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  27.97 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 499 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  28.81 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0544  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 559 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  39.73 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1533  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 559 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0611  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 559 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.361216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1329  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 559 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0812  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 486 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.646381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1730  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 486 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.56 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 479 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>