More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0744 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  49.2 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  49.2 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  47.58 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  47.58 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  31.56 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  35.43 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.27 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.56 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.16 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  26.2 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.82 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  26.2 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  26.7 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  25.67 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  36.44 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.92 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.1 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.85 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.52 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  29.31 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.06 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  26.18 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  26.18 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.85 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  25.65 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.14 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  25.67 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.23 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  28.12 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.95 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  37.38 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.88 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.43 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32.64 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.67 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  22.16 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.56 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>