60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1727 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  47.98 
 
 
269 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  48.39 
 
 
282 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
265 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  46.75 
 
 
266 aa  234  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  47.15 
 
 
266 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 
270 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  45.56 
 
 
270 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  44.05 
 
 
255 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  44.44 
 
 
273 aa  215  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  33.85 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.86 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.86 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  28.26 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  25.82 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
274 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  27.47 
 
 
239 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  24.86 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  25.82 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  24.86 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  25.41 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  24.86 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  24.38 
 
 
187 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.63 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  24.44 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  29.73 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  25 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.51 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  23.81 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.79 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
369 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
1005 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  23.02 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
207 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  23.03 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
207 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  33.68 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.84 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  27 
 
 
885 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
179 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
1106 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>