More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6309 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  100 
 
 		 801 aa  1555    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  61.46 
 
 		 577 aa  572  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  54.81 
 
 		 557 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.57 
 
 		 547 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.64 
 
 		 552 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  55.35 
 
 		 648 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  53.21 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.09 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.13 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.19 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  51.94 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  45.74 
 
 		 608 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  49.23 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  46.17 
 
 		 554 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 575 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  48.14 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  47.62 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.07 
 
 		 605 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  48.55 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  49.02 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.05 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  43.66 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  43.1 
 
 		 558 aa  361  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 574 aa  349  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  46.12 
 
 		 587 aa  337  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  52.37 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 		 572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 538 aa  291  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 565 aa  251  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.95 
 
 		 468 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  31.46 
 
 		 505 aa  181  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.26 
 
 		 460 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  33.95 
 
 		 482 aa  162  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  32.66 
 
 		 518 aa  162  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.64 
 
 		 456 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 452 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.56 
 
 		 450 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 467 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.8 
 
 		 503 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 462 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  34.23 
 
 		 450 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 463 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 500 aa  141  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  140  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  33.11 
 
 		 501 aa  140  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 545 aa  140  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 639 aa  140  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.76 
 
 		 364 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.76 
 
 		 364 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.57 
 
 		 463 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 639 aa  138  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 463 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 483 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 504 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 484 aa  137  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 484 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 484 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.76 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 359 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 466 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 457 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 463 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 358 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 		 1119 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.3 
 
 		 473 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 484 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 484 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 493 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 469 aa  132  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 509 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.66 
 
 		 593 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 464 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 425 aa  131  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  29.69 
 
 		 472 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 453 aa  131  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 406 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 469 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 471 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 480 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>