More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2841 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  52.59 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  53.51 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  48.7 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  47.27 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  45.13 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  45.61 
 
 		 116 aa  84.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  44.55 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  47.96 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  51.43 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  42.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  51.32 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40.17 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  46.05 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  42.42 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  34.44 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.79 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.44 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.82 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  39.81 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.63 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>