50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2825 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  33.12 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.91 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  24.71 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.74 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  24.78 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.33 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 375 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  29.59 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.83 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.75 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  22.04 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  24.48 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.5 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  23.65 
 
 		 254 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 360 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 256 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 256 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 285 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 285 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>