More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1763 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  100 
 
 
341 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  63.93 
 
 
342 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  61.18 
 
 
343 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  61.47 
 
 
340 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  58.24 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  62.05 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  60 
 
 
345 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  57.02 
 
 
344 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  60.77 
 
 
341 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  56.81 
 
 
345 aa  360  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  56.97 
 
 
368 aa  359  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  54.55 
 
 
349 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  54.12 
 
 
339 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  54.55 
 
 
341 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
339 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
339 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
339 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  54.23 
 
 
344 aa  346  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  56.07 
 
 
349 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  51.88 
 
 
348 aa  342  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  55.23 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  52.54 
 
 
339 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
357 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
333 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  47.19 
 
 
332 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
341 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
352 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
313 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
335 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.5 
 
 
325 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
325 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
313 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
353 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44.35 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  44.65 
 
 
309 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
328 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
313 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
351 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.53 
 
 
349 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
344 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.44 
 
 
315 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
337 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  41.9 
 
 
334 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.84 
 
 
334 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
335 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40 
 
 
327 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  41.84 
 
 
358 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
331 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
352 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
349 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
360 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
326 aa  222  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
335 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
337 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
326 aa  222  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
358 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  43.58 
 
 
317 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.3 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.44 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  40.24 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  36.91 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  40.91 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.62 
 
 
335 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
343 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.67 
 
 
343 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
337 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  40 
 
 
339 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
331 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
337 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  42.52 
 
 
319 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  38.7 
 
 
350 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
349 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
317 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
351 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
335 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
351 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
336 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
328 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
336 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
325 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
354 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
357 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>