More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1753 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
705 aa  1409    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  44.14 
 
 
307 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  43.06 
 
 
312 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  46.33 
 
 
329 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
390 aa  181  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8508  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 
309 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.0306024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 
315 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  36.39 
 
 
392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  36.13 
 
 
392 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  35.6 
 
 
392 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  31.15 
 
 
374 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  38.85 
 
 
325 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
389 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
397 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  35.25 
 
 
907 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.92 
 
 
375 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  27.41 
 
 
385 aa  134  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  34.56 
 
 
884 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  28.3 
 
 
751 aa  124  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
383 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  29.93 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
385 aa  115  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
312 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  27.64 
 
 
754 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
327 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
308 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  36.77 
 
 
394 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.81 
 
 
434 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.52 
 
 
388 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
282 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  37.22 
 
 
394 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
324 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
306 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
325 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
294 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  30.97 
 
 
420 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
409 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  28.12 
 
 
741 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
327 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
397 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  30.45 
 
 
783 aa  98.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
400 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
305 aa  97.4  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  35.1 
 
 
412 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
314 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.51 
 
 
318 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
318 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
324 aa  96.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
318 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
317 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  29.29 
 
 
814 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
388 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
313 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
293 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
327 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
334 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.86 
 
 
411 aa  94.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  32.6 
 
 
443 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
397 aa  94.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
324 aa  94.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
318 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
422 aa  94  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.77 
 
 
427 aa  94  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.77 
 
 
427 aa  94  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
378 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
411 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
324 aa  93.2  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
395 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
336 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
406 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
322 aa  92.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
306 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
385 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
303 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
394 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  31.86 
 
 
405 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
311 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
390 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
403 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
336 aa  89.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
318 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
401 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
289 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
321 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
308 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
382 aa  87.4  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
324 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  26.47 
 
 
407 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.83 
 
 
1293 aa  87.4  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
324 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
300 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.94 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.3 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>