More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0055 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1171 aa  2267  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
1509 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
996 aa  185  5e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  39.48 
 
 
565 aa  179  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.14 
 
 
1561 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
342 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  38.07 
 
 
354 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
344 aa  114  1e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
311 aa  113  2e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  21.78 
 
 
619 aa  113  2e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.61606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
350 aa  113  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 
334 aa  107  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
348 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.12 
 
 
321 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  33.63 
 
 
313 aa  101  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  31.82 
 
 
313 aa  101  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
337 aa  99  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
315 aa  97.8  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
341 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
324 aa  95.9  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  1.62414e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
308 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 
313 aa  95.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
349 aa  92.8  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 
331 aa  92.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  31.86 
 
 
332 aa  91.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.49 
 
 
241 aa  90.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  89.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  2.90408e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
309 aa  89  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
306 aa  88.6  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
325 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 
302 aa  87  2e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  31.22 
 
 
334 aa  87  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
313 aa  85.5  5e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
312 aa  84.7  9e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  32.35 
 
 
332 aa  84  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
310 aa  83.2  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.77 
 
 
302 aa  82.8  3e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
338 aa  82  7e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.78 
 
 
326 aa  81.3  1e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.67 
 
 
325 aa  80.9  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
234 aa  80.9  1e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
303 aa  79.7  3e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
330 aa  78.6  7e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
329 aa  77.8  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
312 aa  77  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
312 aa  77  2e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
242 aa  75.1  8e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
298 aa  73.6  2e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
322 aa  70.5  2e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1202  hypothetical protein  29.11 
 
 
585 aa  70.1  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  31.7 
 
 
339 aa  67.4  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  26.7 
 
 
329 aa  66.2  3e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
301 aa  65.1  8e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
256 aa  64.3  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
709 aa  64.7  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
709 aa  64.7  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
332 aa  63.5  2e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.01 
 
 
266 aa  63.2  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
367 aa  63.5  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
310 aa  63.2  3e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
342 aa  63.2  3e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 
341 aa  62.4  4e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.32 
 
 
266 aa  62.8  4e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  27.32 
 
 
266 aa  62.8  4e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.32 
 
 
266 aa  62.8  4e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 
266 aa  62.4  5e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.34346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.59 
 
 
266 aa  62  6e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
265 aa  62  7e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
247 aa  61.6  8e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
313 aa  61.6  8e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
259 aa  61.2  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.3 
 
 
312 aa  61.2  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
348 aa  60.1  2e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
249 aa  60.5  2e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  6.35475e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
260 aa  60.5  2e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
880 aa  60.1  2e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
363 aa  59.7  3e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
347 aa  59.7  3e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
983 aa  59.3  4e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  31.71 
 
 
249 aa  59.3  4e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 
350 aa  58.9  6e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
322 aa  58.9  6e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
1035 aa  58.5  7e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
334 aa  58.5  7e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
256 aa  58.2  8e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
857 aa  58.2  9e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
376 aa  57.4  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
252 aa  57.8  1e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
1084 aa  57.4  1e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
338 aa  57.8  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 
252 aa  56.6  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
308 aa  57.4  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
1162 aa  57  2e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
347 aa  57  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  24.64 
 
 
237 aa  57.4  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.75 
 
 
296 aa  57.4  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
721 aa  57.4  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
280 aa  57.4  2e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
249 aa  57.4  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
398 aa  56.6  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>