151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1157 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  100 
 
 
534 aa  1079    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  97.19 
 
 
534 aa  1050    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  60.86 
 
 
544 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  66.8 
 
 
529 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  48.22 
 
 
538 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  42.48 
 
 
523 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  44.62 
 
 
529 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  41.7 
 
 
523 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  40.94 
 
 
522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  42.83 
 
 
525 aa  355  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  41.95 
 
 
530 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  41.44 
 
 
528 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  45.62 
 
 
524 aa  349  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  42.25 
 
 
555 aa  349  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  43.87 
 
 
558 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  40.7 
 
 
528 aa  346  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  41.25 
 
 
529 aa  346  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  40.11 
 
 
534 aa  343  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  43.4 
 
 
549 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  39.41 
 
 
530 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  41.45 
 
 
531 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.2 
 
 
524 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 
535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  41.57 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  40.32 
 
 
538 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  38.17 
 
 
563 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  40.69 
 
 
531 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  40.88 
 
 
523 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  42.48 
 
 
523 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.87 
 
 
540 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  41.29 
 
 
545 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  41.08 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  39.25 
 
 
515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  40.3 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  38.08 
 
 
530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  41.25 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  42.05 
 
 
513 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  40.57 
 
 
502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  40.75 
 
 
529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  41.25 
 
 
618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  39.33 
 
 
519 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  40.3 
 
 
554 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  36.92 
 
 
521 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  38.49 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  36.96 
 
 
552 aa  282  9e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.18 
 
 
555 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  38.72 
 
 
522 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  38.45 
 
 
523 aa  270  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  37.38 
 
 
521 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  35.38 
 
 
531 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  38.87 
 
 
520 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  36.12 
 
 
540 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  35.33 
 
 
587 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  35.65 
 
 
540 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  35.86 
 
 
550 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  36.36 
 
 
541 aa  233  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  34.54 
 
 
541 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  35.25 
 
 
532 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  35.61 
 
 
523 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  30.14 
 
 
674 aa  220  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  32.1 
 
 
576 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.82 
 
 
564 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  37.57 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  34.1 
 
 
606 aa  200  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  34.1 
 
 
617 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  34.09 
 
 
574 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  32.94 
 
 
596 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  36.01 
 
 
588 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  65.16 
 
 
209 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  35.73 
 
 
588 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  35.73 
 
 
588 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  35.73 
 
 
588 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  34.32 
 
 
583 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 
588 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  31.13 
 
 
590 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  36.77 
 
 
588 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  35.18 
 
 
589 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  28.84 
 
 
641 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  30.12 
 
 
557 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  35.85 
 
 
600 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  34.89 
 
 
589 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  35.18 
 
 
585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  29.95 
 
 
575 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  39.57 
 
 
588 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  29.49 
 
 
557 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.8 
 
 
450 aa  179  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  30.99 
 
 
582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  34.52 
 
 
587 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  35 
 
 
587 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  33.79 
 
 
679 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  28.6 
 
 
622 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  36.65 
 
 
589 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  30.61 
 
 
566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  34.48 
 
 
670 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.12 
 
 
714 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  29.48 
 
 
710 aa  140  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.49 
 
 
689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  31.75 
 
 
744 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.78 
 
 
573 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>