36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0773 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  46.31 
 
 		 948 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  44.33 
 
 		 917 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  44.03 
 
 		 918 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  43.91 
 
 		 953 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  44.4 
 
 		 980 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  41.22 
 
 		 961 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  45.22 
 
 		 922 aa  731    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  54.4 
 
 		 942 aa  1045    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  64.37 
 
 		 941 aa  1179    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 943 aa  1914    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  38.34 
 
 		 939 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  39.96 
 
 		 925 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  39.8 
 
 		 919 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  38.56 
 
 		 985 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  38.41 
 
 		 933 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  37.81 
 
 		 948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  34.68 
 
 		 908 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  37.22 
 
 		 970 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  36.67 
 
 		 923 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  35.14 
 
 		 948 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  37.24 
 
 		 917 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1002 aa  353  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  51.31 
 
 		 305 aa  252  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  28.27 
 
 		 795 aa  234  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  44.09 
 
 		 321 aa  220  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  29.97 
 
 		 764 aa  187  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  39.27 
 
 		 262 aa  177  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 286 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  91.3  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  31.47 
 
 		 262 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  22.61 
 
 		 518 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  29.95 
 
 		 231 aa  62  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  26.85 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  22.93 
 
 		 485 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  23.68 
 
 		 273 aa  45.8  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>