143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1922 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 777 aa  1534    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  42.73 
 
 		 815 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.52 
 
 		 774 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 		 614 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  41.16 
 
 		 614 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  38.73 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.06 
 
 		 781 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 		 611 aa  359  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  36.75 
 
 		 693 aa  350  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  35.63 
 
 		 611 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  36.4 
 
 		 672 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  38.45 
 
 		 668 aa  331  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  34.98 
 
 		 608 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  35.94 
 
 		 608 aa  327  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  35.94 
 
 		 608 aa  326  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  33.86 
 
 		 629 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  37.25 
 
 		 677 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  38.27 
 
 		 615 aa  321  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  35.74 
 
 		 612 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  31.85 
 
 		 609 aa  317  6e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  35.62 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  31.31 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  31.31 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  35.39 
 
 		 731 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.83 
 
 		 683 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  36.72 
 
 		 622 aa  311  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 664 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 664 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  34.56 
 
 		 664 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  34.92 
 
 		 674 aa  306  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.55 
 
 		 614 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  31.31 
 
 		 627 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  34.65 
 
 		 654 aa  305  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  34.37 
 
 		 658 aa  303  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  35.78 
 
 		 608 aa  302  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  33.89 
 
 		 682 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  37.02 
 
 		 674 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  33.99 
 
 		 664 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  35.36 
 
 		 608 aa  300  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  34.99 
 
 		 655 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  35.68 
 
 		 608 aa  300  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  35.52 
 
 		 608 aa  300  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  35.52 
 
 		 608 aa  300  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  33.03 
 
 		 629 aa  298  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  36.06 
 
 		 585 aa  296  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  33.28 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  34.65 
 
 		 704 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  35.32 
 
 		 672 aa  290  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  35.4 
 
 		 696 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  35.62 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  34.65 
 
 		 681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  32.95 
 
 		 615 aa  284  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  33.64 
 
 		 685 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  33.61 
 
 		 612 aa  282  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  35.36 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  33.99 
 
 		 672 aa  281  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  35.48 
 
 		 678 aa  277  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  35.09 
 
 		 691 aa  275  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  33.59 
 
 		 664 aa  273  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  34.92 
 
 		 614 aa  270  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 750 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  33.38 
 
 		 678 aa  269  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.98 
 
 		 647 aa  268  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  35.1 
 
 		 677 aa  257  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  37.76 
 
 		 619 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  32.77 
 
 		 667 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  41.96 
 
 		 470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  41.83 
 
 		 365 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.85 
 
 		 656 aa  162  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  29.32 
 
 		 685 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 713 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.24 
 
 		 713 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  27.11 
 
 		 657 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  30.1 
 
 		 650 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.68 
 
 		 647 aa  141  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.68 
 
 		 647 aa  141  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 657 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  41.4 
 
 		 253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  28.48 
 
 		 680 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.88 
 
 		 680 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 657 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 		 657 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  28.26 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.23 
 
 		 133 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40.48 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  37.11 
 
 		 101 aa  64.7  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.63 
 
 		 125 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.53 
 
 		 122 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.23 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.26 
 
 		 122 aa  59.3  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.5 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  35.96 
 
 		 448 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  35.96 
 
 		 448 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  35.96 
 
 		 448 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.03 
 
 		 449 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.77 
 
 		 136 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>