More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2351 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  96.88 
 
 
224 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  97.32 
 
 
224 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  72.48 
 
 
226 aa  327  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  31.47 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  31.41 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  31.25 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0149  hypothetical protein  27.62 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  35.19 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.25 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  30.97 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  28.83 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.01 
 
 
457 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  28.16 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.72 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0049  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  30.14 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.33 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  34.76 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  29.61 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  23.29 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  23.12 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.53 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  29.23 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.53 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  30.58 
 
 
695 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.22 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.53 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.53 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  26.83 
 
 
331 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.54 
 
 
668 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  25.94 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
279 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  31.72 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  24.51 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  30.54 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  31.95 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  28.4 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  23.53 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1401  DedA family protein  24.29 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  30.39 
 
 
217 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  28.28 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  29.34 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  26.61 
 
 
334 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  32.8 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  26.47 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.12 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  30.25 
 
 
331 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  26.57 
 
 
325 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  26.57 
 
 
325 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  35.34 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  26.29 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  31.65 
 
 
681 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  30.37 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.34 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.29 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  29.92 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  28.48 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  23.98 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  23.98 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  24.43 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  25.87 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>